蚕桑蜜蜂研究所下设7个职能科室，6个创新团队（含1个内设团队），重点打造1个院地合作典范——云南现代农业高新技术产业研究院（弥勒）。
一、职能科室职能职责
（一）党政办公室
统筹协调对内对外各级关系，协助所党政领导做好上级部门安排部署的各项具体工作的贯彻落实；负责所党委、行政的决定、决策和部署的贯彻落实及督促检查工作，承担全所综合性公文、会议记录、会议纪要工作；负责全所党建、党风廉政建设、精神文明建设工作，承担全所性宣传、信息管理和文化建设工作；负责全所人才队伍建设及人才项目管理工作；负责全所组织人事和职称职改工作；负责全所公务接待、公务车辆管理；负责全所社保、公积金、离退休人员管理服务及群团、保密、普法、信访、计生、档案等工作；完成所党政班子交办的事项。
（二）财务科
负责与院计划财务处的联系与对接；认真执行会计法和财务制度；负责全所资金的筹集管理，承担依法收支核算、财务预算决算及全所整体支出绩效评价；负责提供全所财务决策咨询依据方案；完成所党政班子交办的事项。
（三）科技管理科
负责与院科研管理处、国际合作处的联系与对接；负责全所科研发展规划及相关管理办法的制定；负责组织建设科研项目库，做好项目申报、过程、统计、验收及科技档案管理工作；负责项目预算及绩效评价管理；负责知识产权、科技成果等无形资产相关管理工作；负责国内外科技合作与交流管理，进行科研信息的收集、整理、分析、宣传；负责审查科研项目合同和项目过程管理；负责中心实验室及实验室易制毒、剧毒药品的管理以及科研危险废物处理的管理；做好科技发展前沿动态、趋势的研究，负责提供科技决策咨询依据方案；承担所学术委员会日常工作；完成所党政班子交办的事项。
（四）成果转化管理科
负责与院科技成果转化管理处联系与对接；负责全所成果转化发展规划及管理办法的制定，做好知识产权、科技成果的转化落地工作；负责组织成果转化项目库和项目申报、过程、统计、验收及档案管理工作；负责成果转化项目预算及绩效评价管理；负责成果推介、示范、展陈、宣传和科技培训；负责审查成果转化类合同、登记和过程管理；负责科技成果转化管理、总结、考核及分配；做好产业发展趋势与政策形势的研究，负责提供产业决策咨询依据方案；承担省蚕学会的日常工作；完成所党政班子交办的事项。
（五）条件平台管理科
负责与院条件平台管理处联系与对接；负责全所条件平台发展规划及管理办法的制定；负责组织条件平台项目库和项目申报、过程、统计、验收及档案管理工作；负责条件平台项目预算及绩效评价管理；负责全所性基建工程的招投标、管理、实施；负责全所性大宗实验仪器设备、大宗物资、大宗服务、办公设备家具及办公用品等采购；负责审查工程类、大宗设备类、办公设备、办公家具等合同和过程管理；负责全所房屋、土地、场所、设备等国有资产管理工作；完成所党政班子交办的事项。
（六）行政科
负责与院行政保卫处联系与对接；负责全所公共房屋、场地的使用管理；负责全所水、电、环境卫生、绿化、物业、房屋维修等管理工作；负责全所社会治安综合治理、安全保卫、安全（消防）生产、户籍和流动人口管理、医保报销等后勤保障服务工作；负责全所性易制毒、剧毒药品和生产生活危险废物处理的管理；完成所党政班子交办的事项。
（七）科技成果转化中心
负责全所科技成果转化、科技服务、良种繁育基地建设管理工作；统筹管理与协调使用全所资源，开展对外成果转化与科技服务具体工作；负责科技成果在关联企业中的转化落地工作；负责关联企业经营及人员管理工作；承担所内科技示范园区的建设和管理；负责全所蚕种安全生产、蚕种技术处理与保护、蚕种质量检验检测，承担省内外蚕种质量检验检测任务；完成所党政班子交办的事项。
二、创新团队职能职责
（一）家蚕与资源昆虫创新团队
开展家蚕资源收集、保护、评价与研究利用和品种选育工作，研究家蚕育种新方法、新技术，解决家蚕育种、饲养技术重大科技问题，为产业提供优良家蚕品种、良种繁育技术支撑和科技服务；开展绢丝和食（药）用资源昆虫收集、评价与研究利用；研究不同资源昆虫规模化、标准化、质量安全养殖技术体系及昆虫蛋白的开发利用。
（二）蚕桑与农业绿色防控创新团队
开展蚕桑与特色果蔬菜等经济作物病虫害绿色防控关键问题研究、防控技术指导和服务；主要病害流行监控、病原遗传变异与检测技术研究、病原致病与宿主抗病或耐病机制解析、防治药物筛选、防控技术研究、集成与推广；蚕桑与特色果蔬菜等经济作物主要虫害成灾机制、绿色防控药物筛选、抗药性监测、综合防控技术研究、集成与推广；杀虫微生物收集评价利用；天敌昆虫、药用昆虫资源收集评价、繁育利用。
（三）大食物观产品创新团队
立足“大食物观”，紧跟研究热点，围绕桑、蚕、蜂、特色昆虫和微生物来源的蛋白，研发功能性替代蛋白新产品，开展农产品采后贮藏与保鲜及生理变化机制研究，深入挖掘云南特色蜂产品中的生物活性物质及功能，对原有的蚕、桑、蜂产品进行精深加工，提升产品附加值，延伸产业链，提高我所在云南省特色食品领域的竞争力，为产业提供新产品、绿色食品与加工技术支撑和科技服务，实施新产品与加工技术成果转化，助推我省世界一流“绿色食品牌”的打造，完成相关平台条件建设、人才培养及科技服务。
（四）蜜蜂与授粉昆虫创新团队
开展蜜蜂与授粉昆虫种质资源收集、评价、保存、利用研究；良种选育及繁育技术研究应用与示范；蜜蜂病虫害及农业绿色防控技术研究与应用；传粉蜂授粉效果评价与授粉机制研究及应用；蜜蜂科学化、规模化、规范化饲养技术研究、成果应用及高效生产技术培训、推广，为云南省蜂产业发展提供科技支撑、科技服务、科技咨询等工作。
（五）现代农业与桑产业创新团队
开展现代设施农业、智慧农业及文旅乡村融合发展和绿色、有机、地理标志农产品及质量控制研究；农业产业发展咨询与设计；桑树及桑产业、林下经济动植物养殖（种植）技术研究与利用；特色果蔬与区域特色水果研究与栽培技术示范。
（六）现代农业创新团队（弥勒）
对标先进，突出开放创新，重点聚焦特色果蔬农业产业开展关键技术研发，围绕种子种业、农业技术培训、农产品检验和未来农业等重点领域开展工作，打造“云南种子种业联合实验室弥勒研发中心”“滇南现代农业科技服务中心”“滇南农产品检验检疫中心”“滇南绿色有机农产品和农产品地理标志认证服务中心”和“滇南现代农业研究中心”。
三、院地合作（云南现代农业高新技术产业研究院）概况
为全面整合地方政府、科研院所优势资源，服务好弥勒高原特色农业高质量发展，支持弥勒市第二批国家创新型县（市）建设，助力创建国家农业高新技术产业示范区，2023年10月10日，云南省农业科学院与弥勒市人民政府签订了科技合作协议，2024年2月6日，正式揭牌成立云南现代农业高新技术产业研究院，由弥勒市人民政府、云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所建立牵头协调机制，负责研究院建设具体协调工作。
研究院坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入贯彻习近平总书记关于“要坚持农业科技自立自强，加快推进农业关键核心技术攻关”，“要加快创新步伐，努力抢占世界农业科技竞争制高点”等重要指示，深入实施创新驱动战略，搭建科技与产业、企业与高校和科研院所的桥梁，形成具有红河特色的产业集群，构建“政产学研金服用”一体化的协同创新体系，打造全省现代农业制高地、高原特色农业高质量发展引领区。
研究院的主要定位是，聚合国内外一流科技资源，对标国际先进，突出开放创新，立足弥勒、服务全州、辐射全省、面向南亚东南亚，重点聚焦重点农业产业和园区经济，开展关键技术研发，形成园区经济产业集群，打造“云南种子种业联合实验室弥勒研发中心”“云南省大食物观研究中心”“滇南现代农业科技服务中心”“滇南农产品检验检疫中心”“滇南绿色有机农产品和农产品地理标志认证服务中心”“滇南现代农业研究中心”。积极加强与各单位、各机构、各企业的交流与合作，打造全省具有较强影响力的农业科技孵化器。
